L'amministrazione comunale è obbligata ad esaminare l'istanza di condono edilizio e tutta la documentazione integrativa presentata, al fine di definire il relativo procedimento mediante l'adozione di un provvedimento espresso di accoglimento o di rigetto della richiesta, ovvero, in alternativa, mediante il rilascio di un'attestazione relativa all'intervenuto perfezionamento della fattispecie tacita del cd. silenzio-assenso, con indicazione della relativa data. Il silenzio serbato dall'amministrazione comunale sull'istanza di condono edilizio è illegittimo, in quanto l'amministrazione è tenuta a concludere il procedimento con un provvedimento espresso, senza poter invocare l'istituto del silenzio-rigetto previsto per la diversa fattispecie dell'istanza di accertamento di conformità. In caso di persistente inerzia dell'amministrazione comunale, il giudice amministrativo può nominare un commissario ad acta per l'adozione del provvedimento finale.