Il rilascio di un'autorizzazione integrata ambientale (AIA) per un impianto di trattamento meccanico-biologico di rifiuti non pericolosi deve rispettare i limiti quantitativi di rifiuti previsti dalla pianificazione regionale e dagli atti di programmazione emergenziale, senza poter incrementare unilateralmente tali quantità senza adeguata motivazione. L'AIA deve altresì recepire gli accordi e le convenzioni sottoscritti tra l'ente locale e il gestore dell'impianto, in particolare per quanto riguarda le misure di compensazione ambientale a favore del territorio interessato. Il mancato rispetto di tali prescrizioni determina l'illegittimità dell'AIA, salvo che l'ente locale non abbia espressamente accettato in sede di conferenza di servizi le modifiche apportate. Il principio di leale collaborazione tra enti pubblici impone infatti che il dissenso su specifici aspetti dell'AIA sia manifestato in modo formale e motivato all'interno della conferenza di servizi, a pena di decadenza dal diritto di impugnare successivamente il provvedimento finale.