Il principio di diritto fondamentale che emerge dalla sentenza può essere così sintetizzato: Il silenzio-assenso e il provvedimento tacito di accoglimento dell'istanza, pur rappresentando istituti volti a semplificare e accelerare i procedimenti amministrativi, non possono essere annullati dall'amministrazione in modo arbitrario o per meri vizi formali, ma solo in presenza di specifiche e motivate ragioni di interesse pubblico prevalente, nel rispetto dei principi di buona fede, affidamento e proporzionalità. L'annullamento di tali provvedimenti taciti deve essere adeguatamente motivato, senza che possa essere sufficiente il mero richiamo a pareri negativi espressi in sede di conferenza di servizi, laddove non siano state previamente valutate tutte le soluzioni possibili per superare le criticità emerse e consentire comunque la realizzazione dell'intervento, nel rispetto della normativa urbanistica ed edilizia vigente. L'amministrazione è tenuta a garantire il contraddittorio con l'interessato e a bilanciare tutti gli interessi pubblici e privati coinvolti, prima di adottare un provvedimento di annullamento di un provvedimento tacito favorevole al privato.