Il decorso del termine per l'adozione del provvedimento conclusivo sulla domanda di permesso di costruire comporta la formazione del silenzio-assenso, indipendentemente dalla conformità dell'intervento edilizio alle norme urbanistiche vigenti, fermo restando il potere dell'amministrazione di annullare d'ufficio il provvedimento tacito ai sensi dell'art. 21-nonies della legge n. 241/1990. L'amministrazione non può opporre il mancato perfezionamento del silenzio-assenso per contrasto dell'intervento con la disciplina urbanistica, essendo sufficiente il solo decorso del termine procedimentale, salvo i casi di vincoli relativi all'assetto idrogeologico, ambientali, paesaggistici o culturali. Il silenzio-assenso si forma anche quando l'attività oggetto del provvedimento richiesto non sia conforme alle norme, senza che ciò incida sulla sua formazione, rilevando tale profilo solo in termini di illegittimità dell'atto ai fini dell'annullamento d'ufficio. L'amministrazione, decorso il termine, può intervenire solo in autotutela sull'assetto di interessi formatosi silenziosamente.