Il rilascio del permesso di costruire in sanatoria ai sensi dell'art. 36 del D.P.R. n. 380/2001 è subordinato alla conformità dell'intervento edilizio realizzato in assenza o in difformità rispetto al titolo abilitativo, non solo con gli strumenti urbanistici ed edilizi vigenti al momento della realizzazione, ma anche al momento della presentazione della domanda di sanatoria. Il diniego di sanatoria deve essere adeguatamente motivato, indicando specificamente le ragioni ostative all'accertamento di tale conformità urbanistica, non essendo sufficiente il mero riferimento al contrasto con le autorizzazioni paesaggistiche rilasciate, in quanto la valutazione di conformità urbanistica è distinta e autonoma rispetto a quella paesaggistica. L'Amministrazione è tenuta a condurre un'istruttoria approfondita, esaminando nel merito la conformità urbanistica delle opere realizzate, senza limitarsi a considerazioni di carattere meramente formale o a valutazioni generiche e non supportate da elementi di fatto.