Il Comune, nell'esercizio delle proprie attribuzioni istituzionali in materia di governo del territorio, ha il potere di adottare provvedimenti di diniego motivato sulle istanze di permesso di costruire presentate dai privati, anche in contrasto con gli strumenti urbanistici vigenti. Tale potere non può essere surrogato dall'intervento sostitutivo di un commissario ad acta nominato dalla Regione, salvo i casi di effettiva inerzia del Comune, non ravvisabile quando quest'ultimo abbia già adottato un provvedimento espresso di diniego. La nomina del commissario ad acta in assenza dei presupposti di legge lede le attribuzioni istituzionali del Comune, indipendentemente dal contenuto del provvedimento finale adottato dal commissario, e legittima il Comune a impugnare l'atto di nomina, anche in assenza di una specifica impugnazione del provvedimento conclusivo del procedimento sostitutivo. La lesione delle attribuzioni istituzionali del Comune determina la nullità derivata del provvedimento finale adottato dal commissario, non solo la sua annullabilità.