Il permesso di costruire in sanatoria può essere legittimamente revocato dal Comune qualora, all'esito di un'istruttoria tecnica, emerga il mancato rispetto di talune prescrizioni progettuali essenziali per la conformità dell'opera alla disciplina urbanistica vigente, anche se altre parti del progetto risultino invece conformi. La decadenza del titolo edilizio non si estende all'intera opera, ma si limita esclusivamente alla porzione non conforme, in applicazione del principio di proporzionalità e del criterio di conservazione degli atti amministrativi. Pertanto, il Comune non può dichiarare la decadenza dell'intero permesso di costruire in sanatoria, ma solo della parte non eseguita conformemente al progetto autorizzato, in quanto il decorso del termine di ultimazione dei lavori comporta la decadenza del titolo edilizio limitatamente alla "parte non eseguita", ai sensi dell'art. 15, comma 2, terzo periodo, del d.P.R. n. 380/2001. Inoltre, il provvedimento di decadenza del permesso di costruire in sanatoria deve essere preceduto dalla comunicazione di avvio del relativo procedimento, ai sensi dell'art. 7 della legge n. 241/1990, e deve essere adeguatamente motivato in relazione agli specifici profili di non conformità riscontrati, tenendo conto anche delle eventuali deduzioni difensive dell'interessato, ai sensi dell'art. 3 della medesima legge.